La línea de Investigación e Innovación del ecosistema Centro Científico Amazónico es desarrollada principalmente desde la Fundación Centro Científico Amazónico para la Bioeconomía y la Innovación.
Su propósito es generar conocimiento científico aplicado, fortalecer capacidades técnicas y contribuir al desarrollo sostenible mediante investigación, innovación y apropiación social del conocimiento.
La investigación se articula con procesos productivos, cooperación institucional y proyección nacional e internacional.